藥用凍干機的干燥原理是經過將含水的液態制劑式產品低溫冷凍為固態，在真空狀態下加熱固態冰，使固態升華為氣態的水汽，最終將含水汽的空氣抽至水汽消除容器中，然后達到枯燥的意圖。
藥用凍干機的保護保養：
凍干設備的保護保養關鍵在于設備的日常保護，設備主管部門應擬定詳細的設備運用操作程序和設備保護保養程序。設備運用前后派專人對設備進行查看，運用過程中操作人員要守時觀察設備運行參數（控溫參數、控溫時間、設備制冷壓力等），出現不正確值時應當及時陳述設備保護部門查看，便利及時發現毛病。?
樹立設備運用檔案管理和驗證程序，對剛投入運用或者大修后的設備應當依據各運用要求和設備的規劃目標進行設備驗證，驗證經過后方可運用。依據裝置設備規劃的要求提供不低于要求的設備運用環境，做好設備衛生作業。樹立設備毛病應急處理辦法，做好備件作業等。
現在較好的設備保養辦法是預防性保護，預防性保護是為消除設備失效和生產計劃外中止的原因而擬定的辦法，作為制作過程規劃的一項輸出。從預防醫學的態度動身，對設備的異狀前期發現和前期治療。提前樹立設備毛病原因、表征及處理文件，定時巡視查看，提早發現設備毛病。
凍干系統毛病的主要原因：
(1)凍干系統規劃缺點、制作質量不過關。
(2)操作人員操作失誤。
(3)設備運用時的部件老化、振動、磨損。
(4)保護保養程序不健全、不落實。
(5)運用環境不達標，超負荷運行。
(6)過維修。
